生物信息学

课程介绍 Course Introduction

学分：3 | 先修课：分子生物学、计算机基础 | 学期：秋季学期

本课程将生物学与计算机科学相结合，介绍利用信息技术研究生物数据的方法。内容包括生物数据库检索、序列比对与分析、基因预测与注释、蛋白质结构预测、系统发育分析、基因表达数据分析等。课程还介绍常用生物信息学工具如BLAST、Clustal、MEGA、R语言等的使用。学生将掌握利用生物信息学方法分析和解决生物学问题的能力。

This course combines biology with computer science, introducing methods for studying biological data using information technology. Topics include biological database searching, sequence alignment and analysis, gene prediction and annotation, protein structure prediction, phylogenetic analysis, and gene expression data analysis.

大作业 Final Project

作业标题：同源基因序列比对与系统发育分析

选择一个感兴趣的基因家族，从NCBI等数据库中检索不同物种的同源基因序列。使用Clustal Omega进行多序列比对，利用MEGA软件构建系统发育树（包括邻接法和最大似然法），分析基因的进化关系。结合基因结构和保守结构域分析，撰写完整的生物信息学分析报告。

Select a gene family of interest, retrieve homologous gene sequences from different species using databases such as NCBI. Perform multiple sequence alignment using Clustal Omega, construct phylogenetic trees using MEGA with neighbor-joining and maximum likelihood methods.